マジックワンドは外側の領域に対して、要素が入りますので内側の領域内にも要素が入ってしまいます。その為、入力後内側の領域を削除する必要があります。

【1】マジックワンドを使用して入力した要素を選択し、黒い点上で長押しペットパレットが出たらポリゴン削除をクリックします。

【2】マジックワンドのアイコンをクリックし、建物の中に余分に入ってしまったところでクリックすることで削除が出来ます。